发生一连串离奇的死亡案件后，公诉检察官莎拉·辛克莱和犯罪特侦处的探员詹姆斯·布拉德，发现一个以生化面具为核心、前所未见的诡异阴谋。

位于东京御台场，拥有自由校风和多项专科的人气高中「虹咲学园」。对学园偶像的魅力感到心动的普通科2年级高咲侑，和儿时玩伴上原步梦一起敲响了「学园偶像同好会」的门。

担任儿童节目大哥哥的体操哥哥，但其实是个讨厌工作的社会人，扮演布偶的两名後辈、不知在想什麼的歌唱哥哥，及出道经历不顺的前偶像歌唱姊姊……这些人又会怎麼带领小朋友呢……

她们是生前来自不同时期的少女，集结成为特别的偶像团体，目标只有一个：唱吧！跳吧！战斗吧！现在，少女们卷土重来，再次登上了舞台！

本该是高中女生的「我」居然在不知不觉间来到未知之地，还转生成「蜘蛛」怪物了！？虽然我成功逃离喜欢同类相食的蜘蛛父母，却不小心闯进怪物们的巢穴。在这个毒蛙、大蛇、巨猿还有龙四处横行的可怕迷宫里，只是一只小蜘蛛的「我」有办法存活吗……真是……开玩笑也该有个限度吧！造成这种状况的元凶快给我出来──！在各方网友的热烈声援之下，蜘蛛子的生存战略正式展开！

相田爱在老师的信赖下，成为了大贝第一中学学生会会长。在一次社会科的户外活动，她和同学来到地标建筑四叶塔（Clover Tower）参观，一路上忙着照顾众人。就在她终于可以停下来，期待展望台的景色时，巨大的怪物“自我中”突然出现，引起了庞大的混乱。不甘旁人被伤害的相田，遇上了扑克牌王国的精灵夏露露，倚靠不可思议的饰物能量，变身成为光之美少女－－心天使。随后其青梅竹马六花和小学玩伴有栖亦加入光之美少女的行列，誓要一同要把失去“爱”的怪物彻底净化。

小森朱梨（内田彩 配音）是一个身高足足有一米八的健壮女孩，参加了校田径部的她是队内的种子选手，深得同伴和教练的信赖。虽然小森外表看上去不好接近，但实际上个性却非常善良，对于他人的请求，小森无论如何都无法拒绝，虽然这样的特质给她惹出了不少的麻烦，却也令她在不知不觉之中掌握了很多他人鲜少能够掌握的特殊技能。

小烈和小豪是模型四驱车的爱好者，小小年纪的他们已经懂得了很多模型四驱车的知识，加上有模型四驱车专家土屋博士的帮助，他们的四驱车已经在各种比赛中屡屡获奖。然而，最近突然出现了一些极具毁灭性的赛车，它们不仅拥有绝对的速度优势，而且能将对手的四驱车压得粉碎！原来，这是邪恶的大神博士研发的新一代的四驱车。为了捍卫荣誉，打败大神博士的车队，小烈和小豪开始对他们的四驱车开始进行彻底改造！

皿屋敷中学的不良少年浦饭幽助终日无所事事，或与青梅竹马雪村萤子吵架拌嘴，或拿死对头桑原和真出气。某日，逃课玩耍的幽助从车轮下救起一位小姑娘，自己则被汽车撞死。他的举动出乎灵界的预料，因此得到一个复活的机会。经过一次次的考验，幽助最终在萤子和桑原的帮助下重返人间。

故事发生在面积占据东京都西部的三分之一，居住着230万名人口，其中八成人口是学生的巨大都市“学园都市”。学园都市和外部隔离，研究最尖端科技。所有学生都接受超能力开发，并大都借由药物、催眠术与通电刺激等方式取得超能力。有各种类型不同能力，以范围和威力分为无能力者（Level 0）、低能力者（Level 1）、异能力者（Level 2）、强能力者（Level 3）、大能力者（Level 4）和超能力者（Level5）。故事从学园都市最强的电击公主“超电磁炮”御坂美琴，某天认识了和黑子一样担任风纪委员的初春饰利开始......

面积占东京都西部1/3、人口超过230万、八成以上由学生组成的学园都市，尖端科技发展迅速，超能力开发已经深入到城市的各个角落。超能力水平高达Level 5的御坂美琴（佐藤利奈 配音）如往常一样和初春饰利（丰崎爱生 配音）、白井黑子（新井里美 配音）等好友过着平凡的日子，间或热血爆发挫败各种扰乱城市的阴谋。某天，在调查一起现今卡事件时她邂逅了长点上机学园的布束砥信（叶山郁美 配音），从而得知用美琴的DNA大批量复制超能力者的“量产型能力者计划”。不安定的气氛在都市角落肆意蔓延……

有 230 万人口，其中八成人口为学生的「学园都市」，是比其他地区科技更为先进，并从事「超能力开发」的特殊地区。而整座学园都市中仅有七人的等级 5 超能力者之一御坂美琴，由于她的能力与个性使然，因而被卷入了学园都市中所发生的种种事件……